Unutarnja pudendalna vena nalazi se u glutealnom (stražnjem) dijelu.
Leži između sakrospinoznog ligamenta i sakrotuberoznog ligamenta u stražnjici i straga (iza) ishijalne kralježnice, što je područje kostiju koje viri iz donjeg dijela zdjelice.
Unutarnja pudendalna vena leži uz unutarnju pudendalnu arteriju, koja dovodi kisikovu krv u isto područje. Pudendalni živac također leži uz ove dvije krvne žile i inervira isto područje. Unutarnja pudendalna vena, unutarnja pudendalna arterija i pudendalni živac povezani su debelim slojem tkiva nazvanim obturator internus fascia. Ova povezana skupina naziva se pudendalni kanal.
Unutarnja pudendalna vena odvodi krv osiromašenu kisikom iz međice, a to je područje između vanjskih spolnih organa i anusa, te vanjskih genitalija. Ocijeđeno područje uključuje žarulju penisa (kod muškaraca) ili klitorisa (kod žena), analno područje i urogenitalno područje.
Pritoci unutarnje pudendalne vene uključuju venu lukovice (kod muškaraca), stražnju labijalnu venu (kod žena), skrotalnu venu (kod muškaraca) i donju rektalnu venu. Unutarnja pudendalna vena odvodi se u unutarnju ilijačnu venu. Unatoč svom položaju, duboka leđna vena koja drenira erektilna tijela penisa (kod muškaraca) ne prolazi u unutarnju pudendalnu venu.